sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-AJ-A3EM	1	61735	19769795	2	1
TCGA-AJ-A3EM	1	19772616	19864179	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	19867358	54777917	2	1
TCGA-AJ-A3EM	1	54785779	54859286	4	2
TCGA-AJ-A3EM	1	54860121	57936278	2	1
TCGA-AJ-A3EM	1	57937381	58224590	4	1
TCGA-AJ-A3EM	1	58226005	67311150	2	1
TCGA-AJ-A3EM	1	67311177	67606122	3	1
TCGA-AJ-A3EM	1	67607244	150176837	2	1
TCGA-AJ-A3EM	1	150177309	150772536	12	1
TCGA-AJ-A3EM	1	150772679	150977586	8	1
TCGA-AJ-A3EM	1	150978606	153662949	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	153665141	154548752	9	1
TCGA-AJ-A3EM	1	154552132	167066687	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	167069699	168779348	6	1
TCGA-AJ-A3EM	1	168783060	171988152	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	171988679	172552374	5	2
TCGA-AJ-A3EM	1	172553109	211269741	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	211276586	211895993	19	1
TCGA-AJ-A3EM	1	211901108	213019950	4	1
TCGA-AJ-A3EM	1	213024487	219435097	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	219435388	220180621	6	1
TCGA-AJ-A3EM	1	220191271	233011353	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	233012767	233566518	6	1
TCGA-AJ-A3EM	1	233567996	234178451	5	1
TCGA-AJ-A3EM	1	234180567	234983226	10	1
TCGA-AJ-A3EM	1	234983293	244674568	4	1
TCGA-AJ-A3EM	1	244675366	245441504	10	1
TCGA-AJ-A3EM	1	245445233	248930189	5	1
TCGA-AJ-A3EM	2	12784	32602258	2	0
TCGA-AJ-A3EM	2	32604997	33218373	5	0
TCGA-AJ-A3EM	2	33222135	43316984	2	0
TCGA-AJ-A3EM	2	43319819	43667150	4	2
TCGA-AJ-A3EM	2	43667290	64001646	2	2
TCGA-AJ-A3EM	2	64008053	64083266	5	2
TCGA-AJ-A3EM	2	64085008	94820686	2	2
TCGA-AJ-A3EM	2	94821485	95671377	1	0
TCGA-AJ-A3EM	2	95675730	96403874	1	1
TCGA-AJ-A3EM	2	96404141	98275482	2	1
TCGA-AJ-A3EM	2	98278970	99603955	1	1
TCGA-AJ-A3EM	2	99604859	99956563	1	0
TCGA-AJ-A3EM	2	99959842	112652438	1	1
TCGA-AJ-A3EM	2	112662624	113158536	2	1
TCGA-AJ-A3EM	2	113159317	113569606	5	2
TCGA-AJ-A3EM	2	113574198	170500008	2	1
TCGA-AJ-A3EM	2	170503406	170621824	5	1
TCGA-AJ-A3EM	2	170621892	203951852	2	1
TCGA-AJ-A3EM	2	203957542	242147305	1	1
TCGA-AJ-A3EM	3	18667	13936563	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	13948988	14665156	5	1
TCGA-AJ-A3EM	3	14669081	16389184	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	16392899	16689409	4	1
TCGA-AJ-A3EM	3	16696563	37474336	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	37474592	38247684	2	2
TCGA-AJ-A3EM	3	38249370	48774346	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	48776262	56624119	1	1
TCGA-AJ-A3EM	3	56633452	72440390	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	72440636	73247413	2	2
TCGA-AJ-A3EM	3	73248019	107843692	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	107850908	107964134	6	2
TCGA-AJ-A3EM	3	107967650	108158358	3	3
TCGA-AJ-A3EM	3	108158616	116535872	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	116544247	116726847	1	0
TCGA-AJ-A3EM	3	116728438	116886124	0	0
TCGA-AJ-A3EM	3	116887001	117074338	1	1
TCGA-AJ-A3EM	3	117076770	117281551	1	0
TCGA-AJ-A3EM	3	117284986	117842470	2	2
TCGA-AJ-A3EM	3	117844869	117940346	1	1
TCGA-AJ-A3EM	3	117940833	118172886	3	1
TCGA-AJ-A3EM	3	118173104	122038942	3	2
TCGA-AJ-A3EM	3	122039138	128532691	3	1
TCGA-AJ-A3EM	3	128532835	128944316	3	0
TCGA-AJ-A3EM	3	128946947	138578126	3	1
TCGA-AJ-A3EM	3	138579140	139155614	17	1
TCGA-AJ-A3EM	3	139156412	149011221	3	1
TCGA-AJ-A3EM	3	149014953	149507236	17	1
TCGA-AJ-A3EM	3	149507490	151278646	14	1
TCGA-AJ-A3EM	3	151280369	168026398	2	1
TCGA-AJ-A3EM	3	168026719	187660927	3	1
TCGA-AJ-A3EM	3	187666067	187793271	21	1
TCGA-AJ-A3EM	3	187794370	188286762	12	1
TCGA-AJ-A3EM	3	188288468	195535470	8	1
TCGA-AJ-A3EM	3	195535719	196849253	5	1
TCGA-AJ-A3EM	3	196849803	198169247	1	0
TCGA-AJ-A3EM	4	12281	38631368	2	1
TCGA-AJ-A3EM	4	38633471	38939212	4	1
TCGA-AJ-A3EM	4	38942187	81314978	2	1
TCGA-AJ-A3EM	4	81324622	81639316	5	1
TCGA-AJ-A3EM	4	81643008	92399317	2	1
TCGA-AJ-A3EM	4	92399446	92800056	2	0
TCGA-AJ-A3EM	4	92802989	180349270	2	1
TCGA-AJ-A3EM	4	180349836	180739479	5	1
TCGA-AJ-A3EM	4	180740147	180850312	2	1
TCGA-AJ-A3EM	4	180850342	181139016	5	1
TCGA-AJ-A3EM	4	181141171	190106768	2	1
TCGA-AJ-A3EM	5	15532	33554004	2	2
TCGA-AJ-A3EM	5	33554770	33598804	5	2
TCGA-AJ-A3EM	5	33602786	50136997	2	2
TCGA-AJ-A3EM	5	50146124	102524960	2	0
TCGA-AJ-A3EM	5	102530209	102641254	5	0
TCGA-AJ-A3EM	5	102646335	102681011	2	0
TCGA-AJ-A3EM	5	102681890	102799703	5	0
TCGA-AJ-A3EM	5	102802825	140202942	2	0
TCGA-AJ-A3EM	5	140208508	140505733	4	0
TCGA-AJ-A3EM	5	140507683	154612840	2	0
TCGA-AJ-A3EM	5	154613238	154732316	4	0
TCGA-AJ-A3EM	5	154738192	181363319	2	0
TCGA-AJ-A3EM	6	149661	3708125	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	3708966	4028587	5	1
TCGA-AJ-A3EM	6	4030474	30850089	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	30850102	30954793	4	1
TCGA-AJ-A3EM	6	30960090	32658841	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	32682835	34281426	5	1
TCGA-AJ-A3EM	6	34281769	42611622	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	42613260	42788734	7	2
TCGA-AJ-A3EM	6	42791112	48404192	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	48408595	58416164	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	58416347	67707968	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	67720019	68487337	3	1
TCGA-AJ-A3EM	6	68487358	105363632	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	105364104	107401344	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	107410354	107757817	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	107757917	111567409	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	111573787	111700218	5	2
TCGA-AJ-A3EM	6	111701865	113462043	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	113462439	113748714	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	113750518	114067748	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	114071340	118167846	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	118168215	118551137	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	118553182	143044401	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	143054989	143268677	2	1
TCGA-AJ-A3EM	6	143270961	151392675	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	151395044	151800723	4	2
TCGA-AJ-A3EM	6	151801264	157456677	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	157458220	158107052	4	2
TCGA-AJ-A3EM	6	158107828	162911819	2	2
TCGA-AJ-A3EM	6	162912266	165203703	5	2
TCGA-AJ-A3EM	6	165205564	170741917	2	2
TCGA-AJ-A3EM	7	43259	19711463	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	19712126	19997621	4	1
TCGA-AJ-A3EM	7	20003635	50755614	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	50756704	51144276	1	1
TCGA-AJ-A3EM	7	51145910	55423185	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	55424205	64586988	2	2
TCGA-AJ-A3EM	7	64591980	83468602	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	83471700	83846998	5	1
TCGA-AJ-A3EM	7	83850692	105042427	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	105042609	105312937	1	1
TCGA-AJ-A3EM	7	105313019	105877447	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	105879196	106177733	4	1
TCGA-AJ-A3EM	7	106178400	130834319	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	130835205	131143904	2	2
TCGA-AJ-A3EM	7	131144130	139206916	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	139212243	140630394	2	2
TCGA-AJ-A3EM	7	140630481	149217030	2	1
TCGA-AJ-A3EM	7	149217648	150509315	3	1
TCGA-AJ-A3EM	7	150509797	159334314	2	1
TCGA-AJ-A3EM	8	81254	18089578	3	2
TCGA-AJ-A3EM	8	18090499	18433592	7	2
TCGA-AJ-A3EM	8	18434353	21509888	3	2
TCGA-AJ-A3EM	8	21512248	28298939	2	1
TCGA-AJ-A3EM	8	28299323	28919392	4	1
TCGA-AJ-A3EM	8	28921372	43893906	2	1
TCGA-AJ-A3EM	8	43896789	101128470	3	3
TCGA-AJ-A3EM	8	101129443	101504276	6	4
TCGA-AJ-A3EM	8	101506363	106699510	3	2
TCGA-AJ-A3EM	8	106704225	107303470	2	1
TCGA-AJ-A3EM	8	107308557	117969897	3	3
TCGA-AJ-A3EM	8	117972228	118269484	7	2
TCGA-AJ-A3EM	8	118270039	127102754	3	3
TCGA-AJ-A3EM	8	127105861	129131620	7	2
TCGA-AJ-A3EM	8	129132280	129504911	17	2
TCGA-AJ-A3EM	8	129510262	129672737	8	2
TCGA-AJ-A3EM	8	129677096	143153996	3	3
TCGA-AJ-A3EM	8	143158442	143680108	6	2
TCGA-AJ-A3EM	8	143685557	145072769	2	1
TCGA-AJ-A3EM	9	46587	33053064	2	2
TCGA-AJ-A3EM	9	33055473	33668546	5	2
TCGA-AJ-A3EM	9	33678146	36081392	2	2
TCGA-AJ-A3EM	9	36087749	83786129	2	0
TCGA-AJ-A3EM	9	83786260	84520689	4	0
TCGA-AJ-A3EM	9	84520729	127449468	2	0
TCGA-AJ-A3EM	9	127452491	128060592	4	0
TCGA-AJ-A3EM	9	128063290	128852417	2	0
TCGA-AJ-A3EM	9	128853818	129524548	5	0
TCGA-AJ-A3EM	9	129531228	135199398	2	0
TCGA-AJ-A3EM	9	135200959	135307422	4	0
TCGA-AJ-A3EM	9	135307471	138200944	2	0
TCGA-AJ-A3EM	10	26823	11490659	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	11499745	11817305	7	2
TCGA-AJ-A3EM	10	11821050	12100862	4	2
TCGA-AJ-A3EM	10	12101089	24029272	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	24030637	24383900	5	2
TCGA-AJ-A3EM	10	24392221	54524875	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	54533046	54745022	2	0
TCGA-AJ-A3EM	10	54757650	55014872	3	2
TCGA-AJ-A3EM	10	55017264	55465967	5	2
TCGA-AJ-A3EM	10	55472504	62410849	3	2
TCGA-AJ-A3EM	10	62415418	69138596	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	69141467	69772377	4	2
TCGA-AJ-A3EM	10	69772925	70922675	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	70928614	71509153	2	0
TCGA-AJ-A3EM	10	71509539	72730590	4	0
TCGA-AJ-A3EM	10	72736251	95769514	2	0
TCGA-AJ-A3EM	10	95777038	103041497	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	103041908	103373557	4	2
TCGA-AJ-A3EM	10	103379979	118472861	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	118480720	118614127	5	3
TCGA-AJ-A3EM	10	118614567	121241729	2	2
TCGA-AJ-A3EM	10	121242218	121381600	5	2
TCGA-AJ-A3EM	10	121381616	133769379	2	2
TCGA-AJ-A3EM	11	198572	10291085	2	0
TCGA-AJ-A3EM	11	10299654	10360999	4	0
TCGA-AJ-A3EM	11	10363830	12436366	2	0
TCGA-AJ-A3EM	11	12437158	12718004	5	0
TCGA-AJ-A3EM	11	12726375	61785617	2	0
TCGA-AJ-A3EM	11	61795125	62388082	4	0
TCGA-AJ-A3EM	11	62389136	65185151	2	0
TCGA-AJ-A3EM	11	65186582	65245736	4	0
TCGA-AJ-A3EM	11	65249946	65840291	5	2
TCGA-AJ-A3EM	11	65845877	69585449	2	1
TCGA-AJ-A3EM	11	69590840	69708781	5	1
TCGA-AJ-A3EM	11	69715985	121212474	2	1
TCGA-AJ-A3EM	11	121217449	121515238	3	2
TCGA-AJ-A3EM	11	121518624	129000064	2	1
TCGA-AJ-A3EM	11	129003149	129652073	5	1
TCGA-AJ-A3EM	11	129652089	135074876	2	1
TCGA-AJ-A3EM	12	51460	45857409	2	0
TCGA-AJ-A3EM	12	45862777	46463444	2	2
TCGA-AJ-A3EM	12	46467885	47598300	2	0
TCGA-AJ-A3EM	12	47604607	47915739	4	0
TCGA-AJ-A3EM	12	47916896	52835410	2	0
TCGA-AJ-A3EM	12	52836557	71932173	4	0
TCGA-AJ-A3EM	12	71932434	72262145	7	0
TCGA-AJ-A3EM	12	72263571	95311212	2	0
TCGA-AJ-A3EM	12	95315363	111613147	2	2
TCGA-AJ-A3EM	12	111614889	111735404	1	0
TCGA-AJ-A3EM	12	111743267	122776688	2	2
TCGA-AJ-A3EM	12	122777261	122868193	4	2
TCGA-AJ-A3EM	12	122869998	133201603	2	2
TCGA-AJ-A3EM	13	18452809	23256103	2	0
TCGA-AJ-A3EM	13	23264486	24196114	3	0
TCGA-AJ-A3EM	13	24196963	114342922	2	0
TCGA-AJ-A3EM	14	18225647	32336134	2	2
TCGA-AJ-A3EM	14	32336442	32929796	5	2
TCGA-AJ-A3EM	14	32942432	100198289	2	2
TCGA-AJ-A3EM	14	100198956	100404610	4	2
TCGA-AJ-A3EM	14	100406179	106877229	2	2
TCGA-AJ-A3EM	15	19811075	38544710	2	0
TCGA-AJ-A3EM	15	38545081	38901141	3	0
TCGA-AJ-A3EM	15	38901208	72500479	2	0
TCGA-AJ-A3EM	15	72507973	72546432	4	0
TCGA-AJ-A3EM	15	72548983	72556548	3	0
TCGA-AJ-A3EM	15	72557382	73093911	5	0
TCGA-AJ-A3EM	15	73094125	80495768	2	0
TCGA-AJ-A3EM	15	80496476	80595472	7	0
TCGA-AJ-A3EM	15	80606089	89696224	2	0
TCGA-AJ-A3EM	15	89703786	89795378	5	0
TCGA-AJ-A3EM	15	89797303	92586837	2	0
TCGA-AJ-A3EM	15	92586869	92887933	6	0
TCGA-AJ-A3EM	15	92888293	101928837	2	0
TCGA-AJ-A3EM	16	10777	325782	2	1
TCGA-AJ-A3EM	16	326781	403856	5	1
TCGA-AJ-A3EM	16	404266	56576703	2	1
TCGA-AJ-A3EM	16	56578790	57613483	3	3
TCGA-AJ-A3EM	16	57613521	69474516	2	0
TCGA-AJ-A3EM	16	69475603	69943506	4	0
TCGA-AJ-A3EM	16	69943532	90221127	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	150733	4330545	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	4332236	4482208	10	0
TCGA-AJ-A3EM	17	4482321	7162639	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	7164786	8329602	5	0
TCGA-AJ-A3EM	17	8329767	19112339	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	19126843	35828736	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	35830683	36007429	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	36007593	43397410	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	43404354	43447595	6	1
TCGA-AJ-A3EM	17	43456462	43711020	7	0
TCGA-AJ-A3EM	17	43711236	55520120	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	55522204	55637254	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	55637381	75572889	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	75576097	75834108	6	1
TCGA-AJ-A3EM	17	75836840	76166916	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	76167275	76765241	5	0
TCGA-AJ-A3EM	17	76768464	78438839	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	78439527	78747233	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	78747645	80891166	2	0
TCGA-AJ-A3EM	17	80899153	82318990	4	0
TCGA-AJ-A3EM	17	82326004	83090856	2	0
TCGA-AJ-A3EM	18	48133	3107445	2	2
TCGA-AJ-A3EM	18	3108187	3439329	5	2
TCGA-AJ-A3EM	18	3443507	31328952	2	2
TCGA-AJ-A3EM	18	31329239	31347221	5	3
TCGA-AJ-A3EM	18	31347544	61658571	2	2
TCGA-AJ-A3EM	18	61665875	61785730	5	2
TCGA-AJ-A3EM	18	61787218	80257174	2	2
TCGA-AJ-A3EM	19	90910	8153343	2	0
TCGA-AJ-A3EM	19	8161145	29354885	2	2
TCGA-AJ-A3EM	19	29355793	39151725	2	1
TCGA-AJ-A3EM	19	39152089	39577379	2	2
TCGA-AJ-A3EM	19	39581329	44615845	2	1
TCGA-AJ-A3EM	19	44615856	44744558	5	1
TCGA-AJ-A3EM	19	44749847	50219727	2	1
TCGA-AJ-A3EM	19	50221782	50306500	4	2
TCGA-AJ-A3EM	19	50319151	58586487	2	1
TCGA-AJ-A3EM	20	80664	10136526	2	2
TCGA-AJ-A3EM	20	10141564	10269867	5	2
TCGA-AJ-A3EM	20	10271710	32095148	2	2
TCGA-AJ-A3EM	20	32099797	32432266	5	2
TCGA-AJ-A3EM	20	32432442	33691137	2	2
TCGA-AJ-A3EM	20	33695868	34421994	4	2
TCGA-AJ-A3EM	20	34423402	39535351	3	2
TCGA-AJ-A3EM	20	39538874	42317493	2	1
TCGA-AJ-A3EM	20	42318263	51082424	2	2
TCGA-AJ-A3EM	20	51083137	51194759	5	2
TCGA-AJ-A3EM	20	51197523	51378914	7	2
TCGA-AJ-A3EM	20	51379774	51743127	5	2
TCGA-AJ-A3EM	20	51747803	52856031	3	2
TCGA-AJ-A3EM	20	52856898	53127940	6	2
TCGA-AJ-A3EM	20	53128247	53565217	4	2
TCGA-AJ-A3EM	20	53565881	62187237	2	2
TCGA-AJ-A3EM	20	62187856	62682407	5	2
TCGA-AJ-A3EM	20	62682983	62865662	4	2
TCGA-AJ-A3EM	20	62868777	64324800	2	2
TCGA-AJ-A3EM	21	10336543	46677045	2	2
TCGA-AJ-A3EM	22	15294545	17775710	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	17776144	19019471	2	0
TCGA-AJ-A3EM	22	19037293	19978797	3	2
TCGA-AJ-A3EM	22	19984760	20407764	2	0
TCGA-AJ-A3EM	22	20408929	21563034	2	2
TCGA-AJ-A3EM	22	21573613	24349530	2	0
TCGA-AJ-A3EM	22	24349955	27544775	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	27545262	28744247	1	0
TCGA-AJ-A3EM	22	28744738	29508226	2	2
TCGA-AJ-A3EM	22	29508530	31922645	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	31925603	32227065	1	0
TCGA-AJ-A3EM	22	32228616	37391285	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	37393934	38312858	5	1
TCGA-AJ-A3EM	22	38320023	40006544	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	40011114	40606553	2	0
TCGA-AJ-A3EM	22	40606675	41154215	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	41154253	41439104	1	0
TCGA-AJ-A3EM	22	41444403	46704308	2	1
TCGA-AJ-A3EM	22	46705175	50292457	1	0
TCGA-AJ-A3EM	22	50353189	50796027	2	1
TCGA-AJ-A3EM	X	251810	13821304	2	2
TCGA-AJ-A3EM	X	13824361	14090202	5	2
TCGA-AJ-A3EM	X	14090398	32315952	2	2
TCGA-AJ-A3EM	X	32316004	32635703	5	2
TCGA-AJ-A3EM	X	32635728	62509359	2	2
TCGA-AJ-A3EM	X	62532810	150377481	2	1
TCGA-AJ-A3EM	X	150377804	150963629	2	2
TCGA-AJ-A3EM	X	150971553	156004181	2	1
